Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины icon

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины





НазваниеЛекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины
страница1/11
Дата конвертации24.05.2013
Размер1.59 Mb.
ТипУчебное пособие
  1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11
ЛЕКЦИОННЫЙ КУРС ПО ЧАСТНОЙ ВИРУСОЛОГИИ


ВИРУСЫ ВЫЗЫВАЮЩИЕ БОЛЕЗНИ ЖВАЧНЫХ И ОДНОКОПЫТНЫХ


ДЛЯ СТУДЕНТОВ ФАКУЛЬТЕТА ВЕТЕРИНАРНОЙ МЕДИЦИНЫ



Подготовлен:

ВАСИЛЬЕВЫМ Д.А ЛУГОВЦЕВЫМ В.Ю






УЛЬЯНОВСК 2004


УДК: 619:616.9



«Курс лекций по частной вирусологии»
Часть первая А – «Вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных»



Учебное пособие по курсу ВСЭ для студентов факультета ветеринарной медицины (Ульяновская государственная сельскохозяйственная академия. Кафедра микробиологии, вирусологии, эпизоотологии, ветеринарно-санитарной экспертизы).


Данное учебное пособие подготовлено: д б н, академиком РАЕН, профессором Васильевым Д.А. (Ульяновская государственная с-х академия) и DVM, PhD Луговцевым В.Ю (Food and Drug Administration, Center for Biologics Evaluation and Research, Laboratory of Pediatric Respiratory Viral Diseases. Bethesda, MD 20892, USA)


Предлагаемое учебное пособие издается кафедрой микробиологии, вирусологии, эпизоотологии и ветеринарно-санитарной экспертизы согласно ее плану, целью которого является оперативный выпуск отдельных учебных изданий. Это позволяет дать студенту либо новую научную или инструктивную информацию, либо более подробно разъяснить ключевые положения разделов учебных дисциплин, преподаваемых на кафедре. Предлагается общий список литературы использованный при написании данного лекционного материала. Подбор вирусных инфекционных агентов для предлагаемого курса проводился на основе программы лекционного курса вирусологии и ВСЭ читаемого на кафедре.


ВВЕДЕНИЕ.


Вирусы открыты в конце прошлого столетия Бейеринком и Д.И.Ивановским (1892 г. - вирус табачной мозаики), Лефлером и Фрошем (1897 г. - вирус ящура) и Ридом и Кэрролом (1898 г. - вирус желтой лихорадки) на основе измерения их единственной физико-химической характеристики - способности проходить через стерилизующие керамические фильтры, т.е. фильтруемости. Именно это свойство первоначально использовалось для их классификации в качестве отдельной, особой группы патогенных микроорганизмов. Слово вирус (virus), которым были названы новые агенты, в исходном смысле означало заразный яд и исторически в научном контексте впервые было применено врачом эпохи Возрождения Петрусом Форестусом (1522-1597). Окончательное определение вирусов как организмов и генетически обособленных индивидуумов дано А.Львовым (1957, 1962 гг.). Вирусы составляют условное «третье царство» Vira, наряду с царствами про- и эукариотов.

В предлагаемом учебном пособии представленны наиболее характерные вирусы из основных вирусных семейств.

Семейство: Reoviridae.

Таксономическая структура семейства.

Семейство: Reoviridae

Род: Orthoreovirus, Orbivirus, Rotavirus, Coltivirus, Aquareovirus,Cypovirus, Fijivirus,

Phytoreovirus, Oryzavirus.

Характеристика вириона.

Морфология. Вирион икосаэдральной симметрии, но может выглядеть сферическим. Состоит из капсида, сформированного концентрическими протеиновыми слоями, в виде 1-3 четких капсидных чехлов, имеющих внешний диаметр 60-80 нм. Вирусы девяти родов можно подразделить на две группы. Одна группа содержит вирусы, интактные вирусные частицы (или коры) которых содержат относительно большие выступы (spikes) или “башенки”, расположенные на 12-ти вершинах экосаэдра (включая Orthoreovirus, Aquareovirus, Cypovirus, Fijivirus, Oryzavirus и, как и большинство неклассифицированных вирусов беспозвоночных). Вторая группа включает роды, вирусы которых имеют ровные или почти сферические вирионы и кор без крупных поверхностных выступов по вершинам (Orbivirus, Rotavirus, Coltivirus, Phytoreovirus). Важно отметить, что номенклатура для описания вирусных частиц с различным числом интактных капсидных слоев варьирует у разных родов, хотя данная номенклатура может использоваться в любом случае. Транскрипционно активные коровые частицы вирусов, имеющих выступы, имеют только один полный капсидный слой (с симметрией Т=2), к которому прикрепляются выступы (спайки – spikes). У интактных вирусных частиц кор обычно окружен неполным протеиновым слоем (с симметрией Т=13), который перфорирован спайками, и образует внешнее капсидное покрытие. Поэтому, вирусные частицы обычно выглядят имеющими двухслойный чехол. Исключение составляют cypoviruses, имеющие вирион только с одной капсидной оболочкой, эквивалентной “коровой” частице вирусов других родов. У вирусов рода Сypovirus ранскрипционно активная частица с одной оболочкой является интактным вирионом, хотя характерным является то, что частицы некоторых cypoviruses могут смыкаться внутри матрикса протеиновых кристаллов, называемых полиэдрами (polyhedra), которые образованы более чем на 90% вирусным протеином – “полиэдрином”. В противоположность этому, вирусы с гладким кором содержат субкор, который может быть относительно хрупким, с полным протеиновым чехлом (Т=2), который усилен у транскрипционно активных коровых частиц полным слоем коровой оболочки (Т=13). Такие дважды покрытые коровые частицы, не имеют поверхностных выступов (спайков) и в интактном вирионе окружены внешним капсидным чехлом, приобретая вид частиц с тремя слоями оболочки. Самый внутренний протеиновый чехол вирусного капсида имеет диаметр 50-60 нм и окружает 10-12 геномных сегментов, представленных линейными двуспиральными РНК. Для вирусов с гладким кором характерно то, что энзиматически активные минорные протеины вириона также расположены внутри центрального пространства, и прикреплены к внутренней поверхности (с пятиосевым типом симметрии) (включая РНК-зависимую РНК полимеразу (транскриптазу и репликазу), NTPase, хеликазу, кэпирующие и трансметилазные энзимы). Для вирусов, имеющих кор с выступами, некоторые из протеинов-энзимов формируют “башенки” на поверхности кора. Выступы, имеющие внутри полость, используются как каналы для выхода образующихся мРНК, синтезируемых энзимами, связанными с кором.

Частицы вирусов, принадлежащих разным родам, могут покидать инфицированную клетку почкованием (Orbivirus) или почковаться внутрь эндоплазматического ретикулума (Rotavirus), приобретая мембранную оболочку, клеточного поисхождения, хотя во многих случаях оболочка сохраняется не долго. У вирусов некоторых родов протеины внешнего капсида могут быть модифицированы протеазами (такими как трипсин и химотрипсин), что приводит к образованию “инфекционных” или “промежуточных субвирусных частиц”. Такие изменения могут привести к изменению параметров частицы, определяющих прикрепление и проникновение в клетку.

Диаметр вириона 60-80 nm; Mr 120 x 106; плавучая плотность в CsCl 1,36-1,39 г/см3.

Вирусные частицы умеренно резистентны к нагреванию, органическим растворителям (непример, эфиру) и неионным детергентам. Стабильность при различных значениях рН у представителей разных родов различна.

Геном. РНК: двуспиральная, линейная, сегментированная (10-12); 15-20% сухой массы вириона. Mr отдельных молекул РНК составляет 0,2-3,0 х106, всей РНК – 12-20x106. Вирион содержит позитивные и негативные цепи РНК в равных пропорциях – одна копия каждого сегмента на вирион. Интактные вирионы некоторых видов содержат также значительное количество коротких односпиральных РНК. Позитивные цепи каждого дуплекса кэпированы по 5’-концу (структура типа 1). Обе цепи РНК имеют 3’-ОН, и вирусные мРНК не имеют 3’-поли-А.

Другие компоненты вириона. Протеины составляют 80-85% сухого веса вириона. Размер протеинов варьирует по Mr от 15 до 155 х103. Структурными компонентами вириона являются три мажерных капсидных протеина (СР) и некоторые из минорных протеинов. Не менее трех внутренних вирусных структурных протеинов составляют полимеразу и другие ассоциированные энзимы, участвующие в процессе синтеза мРНК и кэпировании (включая полностью консервативную dsRNA-зависимую ssРНК полимеразу (транскриптазу), нуклеотидфосфогидролазу, гуанилилтрансферазу, две трансметилазы и dsRNA-хеликазу).

Зрелый вирион не содержит липидной оболочки. В зависимости от рода миристиловые остатки могут быть ковалентно связаны с одним из вирусных протеинов. Для колти-, рота- и орбивирусов характерно приобретение липидной оболочки на промежуточной стадии морфогенеза или при выходе из клетки, которая впоследствии теряется.

У вирусов некоторых родов, один из поверхностных протеинов, а также мелкие неструктурные вирусные протеины могут быть гликозилированы.

Организация генома и репликация. Вирусные РНК в основном моноцистронные, хотя некоторые сегменты имеют второй функциональный инициирующий кодон или другие ORFs. Протеины кодируются только на одной цепи (мРНК) каждого дуплекса. Проникновение вируса в клетку различается у представителей разных родов, но обычно является результатом потери компонентов внешеного капсида. Транскрипционно-активные родительские вирусные частицы (коры) высвобождаются в цитоплазму клеток. Повторяющаяся асимметричная транскрипция полноразмерных мРНК каждого сегмента dsRNA (двуспиральной РНК) происходит внутри этих частиц. Продукты мРНК, образующиеся в большом количестве с меньших сегментов, выводятся через вершины икосаэдральной частицы. Структуры, обозначаемые вироплазмами или вирусными тельцами-включениями встречаются в отдельных областях цитоплазмы, являющихся местами репликации и сборки вновь образуемых вирусов. При электронно-микроскопическом исследовании вироплазмы выглядят гранулярными средней электроноплотности и могут содержать вновь образующиеся вирусные частицы. Компоненты внешнего капсида приобретаются на периферии вироплазм.

Механизм синтеза и ассемблирования генома изучен недостаточно. Относительно ортореовирусов показано, что кэпированные мРНК и определенные NS протеины инкорпорируются внутрь “комплекса”, считающегося предшественником будущих вирусных частиц. Затем мРНК используется в качестве матрицы для одного раунда синтеза негативной цепи, с образованием сегментов dsRNA. Разные мРНК находятся в цитоплазме в разных соотношениях. Однако dsRNA геномные сегменты обычно упаковываются в точном эквимолярном соотношении (одна копия каждого геномного сегмента в одной частице). Сегменты РНК имеют коныервативные терминальные последовательности по обоим концам, которые используются как сигналы распознавания для РНК транскриптазы или репликазы. Эти сиквенсы также могут иметь значение для селекции и инкорпорирования РНК внутрь новых частиц. Для одного рода описано, что РНК зрелых частиц упаковывается в виде серии концентрических и высокоорганизованных чехлов (shells), с элементами экосаэдральной симметрии.

Кроме родительских субвирусных частиц (коров), вновь образованные коры также синтезируют мРНК, обеспечивая этап амплификации и репликации. В зависимости от рода, некоторые протеины NS участвуют в транслокации вирусных частиц внутри клетки и их выходе. Многие cypoviruses формируют также полиэдры, являющиеся крупными кристаллическими протеиновыми матрицами, включающими вирусные частицы, и участвующими в трансмиссии между отдельными насекомыми-хозяевами. Этапы морфогенеза и высвобождения вируса зависят от рода. Реассортация сегменов генома происходит легко в клетках, коинфицированных вирусами одного вида.

Антигенные свойства. Вирусы позвоночных имеют групповые или серогрупповые (видоспецифические) антигены, а внутри каждой серогруппы – более вариабельные серотип-специфические антигены. Вирусы насекомых и растений могут проявлять меньшую вариабельность по протеинам, вероятно из-за отсутствия антитело-опосредованного селективного прессинга. Между родами антигенного родства не установлено. Некоторые вирусы обладают гемагглютинирующими свойствами.

Биологические особенности. Биологические особенности вирусов зависят от их родовой принадлежности. Некоторые вирусы репродуцируются только в определенных видах позвоночных и передаются между хозяевами алиментарно или аэрозольно. Другие вирусы позвоночных (орби- и колтивирусы) реплицируются как в позвоночных, так и в беспозвоночных (москиты, клещи, комары и др.). Вирусы растений реплицируются как в растениях, так и в членистоногих (векторах). Вирусы патогенные для насекомых (cypoviruses) передаются контактно или алиментарно.

Критерии подразделения на виды внутри семейства. Главным критерием для включения вирусного изолята в тот или иной вид внутри семейства является способность к реассортации сегментов генома во время коинфекции. Однако прямых свидетельств реассортации сегменов генома между разными вирусными штаммами недостаточно, поэтому для анализа родства, сходства и различий используются другие методы: идентификация естественных хозяев и векторов, клиническое проявление, серологические особенности, сравнительный анализ нуклеотидных и аминокислотных сиквенсов, перекрестная гибридизация РНК и кДНК, анализ консервативных областей генома, определение серотипа, определение электрофоретипа (анализ профиля миграции сегментов генома при электрофоретическом разделении), амплификация консервативных областей с использованием ПЦР (с последующим анализом продуктов в перекрестной гибридизации, рестрикционном анализе и секвенированием). Миграция dsRNA геномных сегментов при электрофрезе в полиакриламидном геле (PAGE) сильно зависит от первичной структуры и Mr молекул. Однако миграционные характеристики при электрофорезе в агарозном геле (AGE) зависят только от Mr. Поэтому последний вариант может быть более удобным для идентификации и дифференциации вирусных видов с использованием электрофоретипирования, тогда как PAGE более чувствителен и может быть ипользован для более тонкой дифференциации между штаммами внутри одного вида.

Род: Orthoreоvirus.

Типовой вид: Mammalian orthoreovirus (MRV) (ортореовирус млекопитающих).

Характерные особенности. Инфицируют только позвоночных, распространяются аэрозольным и алиментарным путями. Все члены рода имеют: 1) хорошо определяемую, при негативном контрастировании, капсидную структуру; 2) 10 сегментов dsRNA, представленных тремя крупными (L), тремя средними (М) и четырьмя мелкими (S) сегментами; 3) характерный протеиновый профиль с тремя l, тремя m и четырьмя s первичными продуктами трансляции; 4) 1-2 дополнительных очень мелких протеинов, кодируемых полицистронным геномным сегментом; 5) все члены двух вторых подгрупп индуцируют образование синцития.

Характеристика вириона.

Морфология. Вирион икосаэдральной симметрии, но может выглядеть сферическим, имеет двойную протеиновую капсидную оболочку. Криоэлектронная микроскопия на примере MRV и ARV показала следующее строение вириона. Вирион состоит из центральной части (диаметр 48 нм), содержащей сегменты dsRNA, и внешнего капсида (диаметр 85 нм), имеющего икосаэдральную симметрию (Т=13). Поверхность вириона покрыта 600 пальцевидными выступами (отростками, длиной 10 нм), организованными в 60 гексамерных и 60 тетрамерных кластеров, которые окружают каналы (диаметром 5-8 нм), радиально проникающие через внешний капсидный слой и достигающие центральной полости. Интактные вирионы содержат большие открытые углубления, имеющие форму цветка (пятичленного), придающего капсиду при трехмерном анализе угловой профиль. Промежуточные субвирусные частицы (ISVP), образующиеся при частичном удалении внешних капсидных протеинов, имеют диаметр примерно 80 нм. Цветкообразные структуры могут включать увеличенную форму протеина s1, участвующего в прикреплении к клетке, расположенного по вершинам в виде спайка длиной 40 нм. Коровые частицы, образуемые при более значительном удалении внешних капсидных протеинов, имеют на своей поверхности 150 эллипсоидных узелков и своеобразных “башенок”, расположенных на пятиугольных вершинах. Mr (вириона) 130 x 106, плавучая плотность в CsCl 1,36 г/см3 (1,38 г/см3 – для ISVPs, 1,43 г/см3 – для коровых частиц). S20w 730S, 630S и 470S, для вириона, ISVP и коровых частиц, соответственно. Вирионы стабильны при сильных ионных воздействиях, температуре до 55 оС, значениях рН 2-9, возействии жирорастворителей и детергентов. УФ облучение снижает инфекционность.

Геном.. 10 сегментов линейных двуспиральных РНК, Mr 0,6-2,6 х106. Общая Mr генома MRV-3 около 15х106 (23549 bp); 11,5% сухой массы вириона. По подвижности в геле сегменты были подразделены на три группы: L (L1-L3; 3,8-3,9 kbp), M (M1-M3; 2,2-2,3 kbp) и S (S1-S4; 0,9-1,6 kbp). Полная вирусная частица содержит многочисленные олигонуклеотиды (длиной 2-20 оснований), составляющих примерно 25% общего содержания РНК, три четверти которых представляют собой абортивные повторяющиеся 5’-концевые транскрипты, образованные кор-ассоциированными транскриптазой и кэпирующими ферментами, тогда как остальное составляют олигоаденилаты. Геномные РНК не имеют поли-А, и не содержат ковалентно связанных протеинов. Геномные сегменты dsRNA содержат 5’- и 3’-концевые последовательности по 4-5 bp, которые консервативны у всех 10 геномных сегментов у конкретного вирусного вида. 3’-концевой консенсунсный сиквенс (UCAUC-3’) также консервативен между тремя подгруппами ортореовирусов, как минимум, для четырех геномных сегментов класса S. 5’-концевой консервативный сиквенс различен.

Протеины. Структурные протеины ортореовирусов обозначаются в соответствии с их относительной массой и классом (l1, 2 и 3; m1 и 2; s1, 2 и 3 (для ARV эти протеины обозначаются, соответственно, lА, В и С; mА и В; sА, В и С) (смотри таблицу). Стабилизированная структура внешнего капсида состоит из 200 тримеров продуктов разрезания протеина m1 (Mr 76х103, после разрезания – Mr 72х103 и Mr 4х103). Субъединицы m1 взаимодействуют с мономерами протеина s3, который образует выступы на поверхности вириона. Пентамерные субъединицы протеина l2 формируют цветкообразные структуры и “башенки” по вершинам вириона и кора. Структуры протеина l2 взаимодействуют с тетрамерными субъединицами протеина s3 и с протеином m1С, составляя основу внешнего капсида. Протеин l2 связан с кором вириона. Четвертый компонент внешнего капсида протеин s1, представлен в виде 12 гомотримеров, связанных с вершинами вириона. Протеины l1 и s2 (по 120 копий каждый) представляют собой мажерные структурные протеины внутреннего капсида и взаимодействуют с геномом (обладают способностью связывать dsRNA (двуспиральные РНК). Два структурных протеина вируса l3 и m2 представлены в вирионе 12-ю копиями, расположенными внутри внутреннего капсида. Протеин l3 формирует отростки длиной 7 нм, простирающиеся по направлению внутренней части кора, и образующие нижележащий слой 12-ти вершин капсида. Протеин m2, вероятно, связан со структурами протеина l3.


Сегменты dsRNA, кодируемые протеины ортореовируса млек-щих 3-го серотипа (MRV-3).

DsRNA

Размер, bp

Протеин

Назва

Ние

Размер, Mr (х103)

Количество копий в вирионе

Локали

зация

Функция

L1

3854

l3

142

12

Кор

РНК полимераза

L2

3916

l2(Cap)

144

60

Спайки кора

Гуанилилтрансфераза, метилтрансфераза

L3

3896

l1(Hel)

143

120

Кор

Структурный протеин внутреннего капсида, связывает dsRNA и цинк, NTPase, хеликаза

M1

2304

m2

83

12

Кор

NTPase

M2

2203

m1

m1C

(T13)

d

f

m1N

76


72

59

13

4

30


600


600

Внешний капсид

Мультимеризуется с протеином s3 и разрезается до m1C и m1N, формирует симметрию Т=13 внешнего капсида. Во время процесса проникновения m1C разрезается до d и f, меристилируется N-конец; обеспечивает проникновение через мембрану.

M3

2235

mNS

mNSC

8075

0

Неструктур

ный

Связывает ssRNA и цитоскелет, участвует в упаковке генома (?). mNSC образуется при начале трансляции, его функция не ясна.

S1

1416

s1


s1S

49


16

36


0

Внешний капсид

Неструктур

ный

Протеин прикрепления к клетке, гомотример,гемагглютинин, типоспецифический антиген.

Основной протеин с неясной функцией.

S2

1331

s2

47

120

Кор

Структурный протеин внутреннего капсида, обладает слабой dsRNA-связывающей активностью, возможно участвует в процессах морфогенеза.

S3

1189

sNS

41

0

Неструктур

ный

Связывает ssRNA, возможно участвует в упаковке генома.

S4

1196

s3

41

600

Внешний капсид

Связывает dsRNA, мультимеризуется с m1, характеризуется ядерной и цитоплазматической локализацией, участвует в контроле трансляции.

Другие компоненты вириона. Зрелые вирионы не имеют липидной оболочки. Мажерный протеин внешнего капсида m1 и продукт его разрезания m1N меристилированы по N-концу. Вопрос о гликозилировании протеинов ортореовирусов окончательно не выяснен. Есть свидетельства, что все протеины MRV и ARV могут быть гликозилированы, за исключением мажерного протеина внутреннего капсида (s2 для MRV и s1 (sА) для ARV).

Организация генома и репликация. Геном представлен 10 сегментами dsRNA, упакованных в эквимолярном соотношении (одна копия сегмента на вирион). Сегменты содержат терминальные NTRs, которые короче по 5’-концам (соответственно 12-32 bp и 35-38 bp для MRV-3). Большинство сегментов имеют мажерную ORF (353-1298 кодонов). Один геномный сегмент полицистронный, содержит более одной функциональную ORF.

Полный процесс инфекции включает адсорбцию, проникновение и раздевание коровых частиц (зависящие от низких рН), асимметричную транскрипцию кэпированных неполиаденилированных мРНК (с использованием консервативных механизмов – новая цепь смещается), трансляцию, ассемблирование плюс-цепей внутрь новых субвирусных частиц, переход плюс-цепи в двуспиральную РНК и дальнейшие раунды транскрипции и трансляции мРНК. Финальная стадия репликативного цикла включает ассемблирование внешнего капсида и новых субвирусных частиц, с образованием инфекционных вирионов. Такие частицы скапливаются в виде паракристаллов в перинуклеарных участках ядерной цитоплазмы и высвобождаются после лизиса клетки. Подгруппы 2 и 3 (ARV, BRV и NBV) образуют мультиядерный синцитий (через 10-12 часов от начала инфекции).

Протеин MRV s1, участвующий в прикреплении к клетке, определяет клеточный и тканевой тропизм штаммов и обладает гемагглютинирующей активностью. Аналогичные протеины ARV и NBV s3, имеющие вид мультимерных суперскрученных доменов, сходны с таковыми MRV, но не обладают гемагглютинирующей активностью. Вирусы подгрупп птиц и бабуинов кодируют протеин, связанный с образованием синцития.

Антигенные свойства. Серотип-специфическим антигеном ортореовирусов, взаимодействующим с нейтрализующими антителами является протеин s1 (s3/sС - у птичьих видов). На основе этих антигенов различают 3 серотипа MRV и 5-11 серотипов ARV. Протеины MRV s1 и s1s проявлют штаммовую специфичность и перекрестную цитотоксическую Т-клеточную активность. Протеины MRV l2 и s3 являются группоспецифическими антигенами, аналогичными протеинам ARV l2/lВ и s2/sВ. Гомология по сиквенсу отмечается только между штаммами внутри вида. Наиболее сильное антигенное сходство показано в отношении ARV и NBV.

Биологические особенности. Распространяются алиментарно и аэрозольно; членистоногих переносчиков нет. Отмечается специфичность по отношению к естественным хозяевам (бабуины, летучие мыши, птицы, КРС, человек, обезьяны, овцы, свиньи, змеи). Распространены повсеместно. Ортореовирусы человека, как правило, авирулентны, но могут вызывать заболевания верхних дыхательных путей и энтериты у детей. У мышей ортореовирусные инфекции сопровождаются диареей, замедлением развития, синдромом жирных волос, гепатитами, желтухами, миокардитами, миозитами, пневмониями, энцефалитами и неврологическими симптомами. У домашних животных инфекция сопровождается поражением дыхательных путей и диареями. У обезьян инфекция проявляется развитием гепатита, билиарной атрезии, менингитов, некрозов эпендимы и эпителиальных клеток хороидального сплетения. Изолят BRV был выделен от бабуинов с менингэнцефаломиелитом, а изоляты от змей – от животных с признаками неврологических расстройств. Птичьи ортореовирусы не инфицируют млекопитающих. Исход болезни у птиц варьирует от инаппарантной формы, до летального, что зависит от штамма вируса и возраста птицы. При развитии системной инфекции вирус выделяется из многих тканей. У цыплят болезнь проявляется нарушением оперения, гастроэнтеритами, гепатитами, миокардитами, пневмониями, потерей веса, слабым ростом, гибелью. У индеек ортореовирусная инфекция проявляется в виде энтеритов. У птиц, перенесших острую системную инфекцию, развивается теносиновит, напоминающий патологию ревматоидного артрита у людей.

Критерии подразделения на виды внутри рода. Ортореовирусы включают 4 вида и 2 неклассифицированных вируса. Определяющим критерием для классификации по видам является прямое доказательство обмена генетическим материалом путем реассортации сегментов генома. На данный момент нет сведений о реассортации между четырьмя видами. Представители данного рода могут быть идентифицированы по следующим признакам:

  1. Способность к обмену генетическим материалом путем реассортации сегментов генома во время коинфекции, продуцируя жизнеспособные вирионы.

  2. Идентификация консервативных терминальных сиквенсов геномных РНК внутри вида (абсолютная консервативность 4-8 bp 5’- и 3’-концов).

  3. Идентификация идентичности сиквенсов между протеинами, кодируемыми гомологичными геномными сегментами (более 85% идентичности по аминокислотам внтури вида и 65% - между видами).

  4. Идентификация идентичности сиквенсов между гомологичными сегментами генома (более 75% идентичности по внтури вида и 60% - между видами).

  5. Идентификация серотипа вируса (на основе перекрестной нейтрализации) с вирусным типом, уже классифицированным в качестве вида данного рода.

  6. Демонстрация широкого антигенного сходства по мажерным структурным протеинам внутри вида, с использованием ELISA и иммунопреципитации.

  7. Анализ электрофоретипа с помощью AGE, но не PAGE

  8. Сходная организация полицистронных геномных сегментов.

  9. Идентификация хозяина и клинические признаки.

На основе анализа аминокислотных сиквенсов протеина s2 (мажерный, внутреннего капсида) 4 вида ортореовирусов можно подразделить на 3 подгруппы. Подгруппа 1 включает все нефузогенные изоляты MRV, представленные одним видом MRV и подразделяемые на серотипы. Подгруппу 2 составляют два вида, представленных многочисленными изолятами ARV, выделенными от промышленной птицы (включая несколько серотипов), и NBV (выделенным только однажды от летучих лис). Аминокислотная идентичность по протеину класса S между этими двумя видами составляет 40-60%, идентичность по гомологичным протеинам между подгруппами составляет 20-30%, между изолятами внутри вида – 90%. Два данных вида, образующих синцитий, более близки в антигенном отношении между собой, чем по отношению к другим видам, обладают сходным консервативным концевым сиквенсом сегментов генома и проявляют сходство в организации полицистронного, индуцирующего слияние (fusion-inducing), геномного сегмента S1. По сиквенсной дивергенции и неспособности к реассортации изоляты ARV и NBV подразделяются в отдельные виды в пределах одной подгруппы. Третья подгруппа представлена одним видом BRV. Этот изолят также вызывает образование синцития, но имеет небольшое сходство по сиквенсу (20-30%) и антигенным свойствам с другими фузогенными видами. BRVтакже содержит полицистронный геномный сегмент S4, эквивалентный сегменту S1, с отличающейся организацией гена, протеин слияния, не имеющий сходства с аналогом ARV и NBV, и уникальный консенсунсный сиквенс по 5’-концу.

Два неклассифицированных вируса, выделенных от змей, также способные индуцировать слияние клеток, но не имеющие электрофоретического профиля геномного сегмента, сходного с таковым у ARV и BRV. Ndelle virus (NDEV) ранее обозначался как неклассифицированный орбивирус, однако анализ генома показал высокую степень гомологии с MRV, как минимум, по четырем геномным сегментам.

Виды (4 вида):

Название вида вируса

Название на русском языке

№ генома в генбанке

Аббре-ра

Подгруппа 1

Mammalian orthoreovirus

serotype 1 (strain Lang)

serotype 2 (strain D5/Jones)

serotype 3 (strain Dearing)

Ортореовирус млекопитающих

Cеротип 1 (штамм Lang)

Cеротип 2 (штамм D5/Jones)

Серотип 3 (штамм Dearing)


--

--

L1: M24734; L2: J03488; M1: M27261; M2: M19408; M3: M27262; S1: M10262; S2: M25780; S3: X01627;

S4: K02739

MRV

MRV-1

MRV-2

MRV-3

Подгруппа 2

Avian orthoreovirus

strain S1133


strain 176


strain SK138a

Ортореовирус птиц

Штамм S1133


Штамм 176


Штамм SK138a

S1: L39002; S3: U20642;

S4: U95952

S2:AF059716; S3:AF059720;

S4:AF059724

S2:AF059717; S3:AF059721;

S4:AF059725

ARV

ARV-S1133


ARV-176


ARV-138

Nelson bay orthoreovirus

Ортореовирус Залива Нельсон

S2:AF059718; S3:AF059726;

S3:AF059722

NBV

Подгруппа 3

Baboon orthoreovirus

Ортореовирус бабуинов

S1:AF059719; S2:AF059723; S3:AF059727

BRV

Feline foamy virus

Пенящий вирус кошек

Y08851

FFV

Simian foamy virus 1

Пенящий вирус обезьян 1

Х54482

SFV-1

Simian foamy virus 3

Пенящий вирус обезьян 3

M74895

SFV-3
  1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11

Добавить документ в свой блог или на сайт
Ваша оценка этого документа будет первой.
Ваша оценка:

Похожие:

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconЛекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconЛекционный курс по частной вирусологии часть третья

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconЛекционный курс по частной вирусологии часть вторая

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconЛекционный курс по частной вирусологии часть вторая

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconЛекционный курс по частной вирусологии часть четвёртая

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconВопросы кэкзамену по дисциплине «Внутренние незаразные болезни животных» для студентов 5 курса факультета ветеринарной медицины»

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconМетодические указания к выполнению клинической курсовой работы (истории болезни) для студентов факультета ветеринарной медицины улан-Удэ, 2009

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconКонтрольные задания по ветеринарной фармакологии для студентов факультета ветеринарной медицины, заочной формы обучения пояснительная записка

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconМетодическое пособие для студентов факультета ветеринарной медицины Ставрополь 2003

Лекционный курс по частной вирусологии вирусы вызывающие болезни жвачных и однокопытных для студентов факультета ветеринарной медицины iconРабочий план по курсу «Инвазионные болезни мелких домашних и экзотических животных» для студентов 5 курса очного обучения факультета ветеринарной медицины, 1 (9) семестр 2005-2006 уч год с 10 октября 2005 г по 11 ноября 2006 г

Поместите кнопку у себя на сайте:
Образование


База данных защищена авторским правом ©cow-leech 2000-2013
обратиться к администрации | правообладателям | пользователям
COW-LEECH.RU